醫學中心、區域醫院、地區醫院…等，加強原有之資源連結。
1.醫學中心：醫學中心規劃以大範圍之區域作整體考量，是具有研究、教學訓練及高度醫療作業等多種功能，並通過醫院評鑑，教學醫院評鑑合格的醫院。國立成功大學醫學院附設醫院、財團法人奇美醫院及其台南分院屬之。
2.區域醫院：區域內每40萬人口一間區域醫院及每萬人口三級醫療。一般病床300床以上，具各類專科外，另設有病理、麻醉、放射線和復建，從事需精密診斷與高度技術之醫療工作，經醫院評鑑及教學醫院評鑑合格的醫院，區域醫院應具教學醫院功能，建立健全醫生訓練制度，並培育專科醫生和地區醫院所需人力。行政院衛生署台南醫院、郭綜合醫院、台南市立醫院、財團法人台灣基督長老教會新樓醫院...等屬之。
3. 地區醫院：以醫療區域為考量重點，提供一般專科門診及住院服務，地區醫院的任務是a.負責一般住院醫療工作和專科門診醫療工作。b.急診患者的處理。c.接受基層醫療單位轉送的病，支援基層醫療工作。d.支援基層健保與公衛服務。佳里綜合醫院、行政院衛生署台南醫院新化分院、新興醫院...等屬之。